Mapa de referencia global de las huellas de los factores de transcripción humanos

Área de la Ciencia:

• La genómica
• Biología molecular
• La epigenética

Sus antecedentes:

• El factor de transcripción que se une al ADN regula la expresión génica.
• Las variaciones genéticas en el ADN regulador están vinculadas a enfermedades y rasgos.
• La identificación de las variantes regulatorias funcionales es un desafío.

Objetivo del estudio:

• Mapear exhaustivamente las huellas de los factores de transcripción en todo el genoma humano.
• Comprender el papel de la accesibilidad del ADN y la ocupación del factor de transcripción en la regulación genética.
• Investigar el impacto de la variación genética en los elementos reguladores.

Principales métodos:

• Se han generado mapas de escisión de DNasa I de alta densidad de 243 tipos de células/tejidos humanos.
• Datos integrados para delinear millones de sitios de ocupación de factores de transcripción en resolución de nucleótidos.
• Analizó la relación entre las variantes genéticas, las huellas y la accesibilidad del elemento regulador.

Principales resultados:

• Delineado ~ 4.5 millones de sitios de ocupación de factores de transcripción en todo el genoma.
• Se encontró que la regulación cis está modulada principalmente por la accesibilidad del ADN, no por la ocupación diferencial de TF.
• Se demostró que las variantes asociadas a la enfermedad se enriquecen dentro de las huellas, con alelos de pérdida / ganancia de función casi iguales.
• Descubrió una mayor densidad de variación genética dentro de las huellas, lo que sugiere un papel en la evolución cis-reguladora.

Conclusiones:

• Proporciona un mapa de alta resolución de los sitios de unión del factor de transcripción.
• Ofrece un marco para analizar los mecanismos reguladores de genes y la variación genética funcional.
• Destaca la importancia de las huellas regulatorias para comprender las enfermedades humanas y la evolución.