Los cambios topológicos a gran escala frenan la progresión maligna en el cáncer colorrectal

Área de la Ciencia:

• La genómica
• Biología del cáncer
• La epigenética

Sus antecedentes:

• El cáncer está asociado con la metilación generalizada del ADN y los cambios en la cromatina.
• El impacto de estas alteraciones en la estructura cromosómica de orden superior no se comprende bien.

Objetivo del estudio:

• Caracterizar las alteraciones en los bucles de cromatina, los dominios topológicamente asociados y los compartimentos del genoma a gran escala en los tumores de colon.
• Investigar las consecuencias funcionales de estos cambios topológicos en la progresión del cáncer.

Principales métodos:

• Integración de mapas topológicos de tumores de colon y de colon normal.
• Análisis de datos epigenéticos, de transcripción y de imágenes.
• Comparación de la organización genómica en células malignas y no malignas.

Principales resultados:

• La partición espacial de los compartimentos abiertos y cerrados del genoma se altera significativamente en los tumores.
• Los cambios topológicos asociados al tumor incluyen hipometilación específica del compartimento y alteraciones de la cromatina.
• Un nuevo compartimiento en la interfaz de compartimiento A/B se reorganiza en los tumores, con desplazamientos similares observados en células no malignas con divisiones excesivas.

Conclusiones:

• Las alteraciones topológicas del genoma asociadas al tumor pueden reprimir los programas de estímulo y invasión.
• Estos cambios pueden inducir genes de inmunidad antitumoral, lo que podría restringir la progresión maligna.
• Los hallazgos desafían la opinión de que las alteraciones epigenómicas en el cáncer son exclusivamente oncogénicas.