El muestreo denso de la diversidad de aves aumenta el poder de la genómica comparativa

Área de la Ciencia:

• La genómica
• Biología evolutiva
• La bioinformática

Sus antecedentes:

• Los proyectos de secuenciación del genoma completo están ampliando el conocimiento de la biodiversidad.
• El muestreo escaso de taxones en filogenética puede conducir a inferencias inexactas y perder la diversidad genómica.

Objetivo del estudio:

• Crear una representación densa de la diversidad filogenética y molecular de las aves.
• Identificar regiones ortológicas y novedades genómicas en los linajes de aves.
• Proporcionar un valioso recurso genómico para estudios evolutivos y de conservación.

Principales métodos:

• Análisis de 363 genomas de aves, incluidos 267 nuevos genomas del Proyecto 10.000 Genomas de Aves (B10K).
• Utilización de una tubería de alineación de todo el genoma sin referencia para la identificación de regiones ortológicas.
• Selección de mapeo a resolución de un solo par de bases en diversos genomas de aves.

Principales resultados:

• Un aumento sustancial de la representación de la diversidad filogenética y molecular aviar.
• Identificación de más regiones ortológicas y características genómicas nuevas de lo que era posible anteriormente.
• Dobló la fracción de bases conservadas y reveló extensos patrones de selección débil en el ADN no codificante.

Conclusiones:

• El aumento de la diversidad genómica en los estudios comparativos mejora el descubrimiento de variaciones compartidas y específicas del linaje.
• El denso conjunto de datos del genoma aviar ofrece nuevas perspectivas sobre los procesos evolutivos.
• Este recurso genómico ayudará en los esfuerzos de conservación de especies.