La endogenización generalizada de virus gigantes moldea los genomas de las algas verdes

Área de la Ciencia:

• La genómica
• Biología evolutiva
• Virología

Sus antecedentes:

• Los elementos virales endógenos (EVE) son genomas virales integrados prevalentes en los eucariotas, que juegan un papel clave en la evolución del genoma.
• La mayoría de los EVE identificados son pequeños, pero los grandes virus de ADN de doble cadena también pueden endogeneizarse.
• Los virus nucleocitoplasmáticos de ADN grande (NCLDV) son de interés debido a sus grandes genomas y orígenes complejos, pero su papel como EVEs es desconocido.

Objetivo del estudio:

• Investigar la prevalencia y las características de la endogenización del NCLDV en los genomas de los eucariotas.
• Determinar si las NCLDV contribuyen significativamente a la escala de los genes virales dentro de los genomas eucariotas.

Principales métodos:

• Análisis de los genomas de algas verdes para identificar las secuencias virales integradas.
• Caracterización del tamaño, contenido genético y características genómicas de los NCLDV endogenizados identificados.
• Análisis genómico comparativo para evaluar el intercambio de genes y la asimilación con los genomas del huésped.

Principales resultados:

• Se descubrió una endogenización generalizada de los NCLDV en diversas algas verdes.
• Estos EVE gigantes superan el millón de pares de bases y contienen hasta el 10% de los marcos de lectura abiertos del anfitrión.
• Los elementos endogenizados muestran evidencia de asimilación, incluidos genes compartidos, intrones y duplicaciones.

Conclusiones:

• Los NCLDV representan una fuente significativa y previamente subestimada de grandes elementos virales endógenos en eucariotas.
• La endogenización de los NCLDV aumenta sustancialmente la escala de los genes virales en los genomas eucariotas.
• Este proceso actúa como un conducto para el nuevo material genético, impactando la composición del genoma eucariota y la evolución.