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Updated: Nov 26, 2025

Development of Inhibitors of Protein-protein Interactions through REPLACE: Application to the Design and Development Non-ATP Competitive CDK Inhibitors
Published on: October 26, 2015
Un ratchet hidrofóbico atrinchera los complejos moleculares
Georg K A Hochberg1, Yang Liu2, Erik G Marklund3
1Department of Ecology and Evolution, University of Chicago, Chicago, IL, USA.
Muchos complejos de proteínas persisten debido a una "raqueta mutacional hidrofóbica". Este mecanismo afianza los ensamblajes moleculares, incluso cuando su multimerización no ofrece una clara ventaja funcional, al hacer que las formas no ensambladas sean inestables.
Área de la Ciencia:
- Biología molecular
- Biología evolutiva
- Bioinformática estructural
Sus antecedentes:
- La mayoría de las proteínas funcionan como complejos de múltiples subunidades.
- La persistencia evolutiva de los complejos de proteínas a menudo se atribuye a la selección de las ventajas funcionales de la multimerización.
- Sin embargo, muchos complejos carecen de funciones conocidas atribuibles a su ensamblaje.
Objetivo del estudio:
- Investigar un mecanismo alternativo para el afianzamiento evolutivo de los complejos proteicos.
- Para probar la hipótesis de que un ratchet mutacional hidrofóbico puede estabilizar complejos independientemente de la función.
- Explorar el papel de la estabilidad de las proteínas y la exposición al disolvente en el mantenimiento de los conjuntos moleculares.
Principales métodos:
- Reconstrucción de proteínas ancestrales y ensayos bioquímicos aplicados a los receptores de hormonas esteroides.
- Análisis bioinformático estructural de las interfaces de las proteínas y sus propensiones mutacionales.
- Análisis de bases de datos de cientos de familias multimer para las firmas de atrincheramiento.
Principales resultados:
- Una interfaz hidrofóbica antigua y conservada en los receptores de hormonas esteroides está arraigada debido a la estabilidad y agregación reducidas al exponerse al disolvente, a pesar de carecer de una función discernible.
- Un sesgo mutacional universal favorece las sustituciones hidrofóbicas en sitios enterrados dentro de las interfaces multiméricas, que son perjudiciales en los monómeros.
- La mayoría de las familias multimer analizadas muestran evidencia de arraigo hidrofóbico a largo plazo.
Conclusiones:
- Una mutación hidrofóbica impulsa sistemáticamente el afianzamiento de los complejos moleculares.
- Este mecanismo explica la persistencia de muchos complejos proteicos, incluso cuando su ensamblaje es funcionalmente gratuito.
- La estabilidad del complejo proteico, impulsada por interacciones hidrofóbicas, puede anular la necesidad de una ventaja funcional en la persistencia evolutiva.
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