La extrusión de bucle media la contracción fisiológica del locus Igh para el escaneo RAG

Área de la Ciencia:

• Inmunología
• Biología molecular
• La genética

Sus antecedentes:

• La endonucleasa RAG inicia la recombinación Igh V(D) J mediante el escaneo de la cromatina en busca de secuencias de señales de recombinación (RSS).
• La extrusión de bucle mediada por cohesión facilita el escaneo RAG de largo alcance, mientras que los elementos de unión CTCF (CBEs) pueden obstaculizar este proceso.
• El locus V(H) sufre una contracción poco comprendida en las células B progenitoras, lo que potencialmente mejora la accesibilidad distal V(H).

Objetivo del estudio:

• Aclarar los mecanismos subyacentes a la contracción del locus V ((H) y su impacto en el escaneo RAG.
• Investigar el papel de la extrusión de bucle y las CBE en la regulación de la recombinación V ((D) J en las células B progenitoras.

Principales métodos:

• Análisis de una inversión del locus V (H) en células B progenitoras primarias de ratón.
• Evaluación de V(H) - RSS y el reordenamiento críptico de RSS.
• Evaluación de la exploración RAG más allá del locus V ((H)).
• Investigación de la expresión y el agotamiento del homólogo de proteínas parecidas a las alas (WAPL).

Principales resultados:

• La inversión de locus V ((H) abrogó V ((H) -RSS y el reordenamiento críptico normalmente convergente de RSS, a pesar de la contracción de locus.
• Inversión activada por la utilización de criptografía orientada en sentido opuesto V{\displaystyle \mathrm {V} }-RSS y RAG escaneando más allá del locus V{\displaystyle \mathrm {R} } .
• La baja expresión de WAPL en las células B progenitoras primarias se correlacionó con la contracción del locus y el escaneo RAG; el agotamiento de WAPL activó estos procesos.

Conclusiones:

• La desregulación de los impedimentos CBE promueve el escaneo RAG del locus V ((H) a través de la extrusión en bucle en las células B progenitoras.
• La extrusión de bucle está implicada en la contracción del locus V (H), con WAPL influyendo en la dinámica de la cohesión.
• Estos hallazgos proporcionan una visión mecanicista de la accesibilidad del locus V (H) y la regulación de la recombinación V (D) J.