Interrogación funcional de las variantes de respuesta al daño del ADN con pantallas de edición de bases

Área de la Ciencia:

• La genética
• Biología molecular
• Investigación del cáncer

Sus antecedentes:

• Las mutaciones genéticas de respuesta al daño del ADN (DDR) comprometen la integridad del genoma, aumentando los riesgos de cáncer y trastornos genéticos.
• Comprender la función del gen DDR es crucial para la investigación de enfermedades.

Objetivo del estudio:

• Identificar nuevas variantes en los genes DDR utilizando el cribado basado en CRISPR.
• Investigar el impacto funcional de estas variantes en la aptitud celular y la estabilidad del genoma.
• Descubrir nuevas funciones del gen DDR y su papel en las enfermedades humanas.

Principales métodos:

• Se emplearon pantallas de edición de bases de citosina dependientes de CRISPR.
• Se utilizaron más de 2.000 sgRNA para generar variantes de nucleótidos en 86 genes DDR.
• Se realizaron ensayos de aptitud celular tras la inducción de daño en el ADN.

Principales resultados:

• Se identificaron más de 2.000 variantes en 86 genes DDR, que afectan la aptitud celular.
• Se descubrieron mutantes de pérdida y ganancia de función en el dominio Tudor de 53BP1, que afectan la unión a USP28.
• Se caracterizaron las variantes TRAIP que definen un dominio que confiere resistencia a la inhibición de la topoisomerasa I.
• Se identificaron mutaciones de ATM quinasa con fenotipos opuestos y mutaciones de pérdida de función de CHK2.

Conclusiones:

• Este estudio proporciona un recurso valioso para descubrir las funciones del gen DDR.
• Las variantes identificadas ofrecen información sobre el papel del gen DDR en el cáncer y los trastornos genéticos.
• Las investigaciones adicionales sobre estas variantes DDR pueden acelerar los estudios en enfermedades humanas.