La proteómica de varios niveles revela perturbaciones del huésped por el SARS-CoV-2 y el SARS-CoV

Área de la Ciencia:

• Virología
• Biología molecular
• Biología de sistemas

Sus antecedentes:

• La propagación global del SARS-CoV-2 requiere comprender las funciones de las proteínas virales y las interacciones del huésped.
• Los estudios omics anteriores proporcionaron información fragmentada sobre la fisiopatología del COVID-19.
• La integración de diversos datos omicos para una visión holística de las interacciones entre virus y huésped es un desafío debido a la heterogeneidad del sistema experimental.

Objetivo del estudio:

• Para llevar a cabo un estudio multiómico simultáneo de SARS-CoV-2 y SARS-CoV.
• Para perfilar los interactomas virales y su impacto en los sistemas celulares del huésped.
• Para identificar los mecanismos moleculares comunes y distintos de estos coronavirus.

Principales métodos:

• Perfiles multi-ómicos simultáneos (proteómicos, transcriptómicos, ubiquitinómicos, fosfoproteómicos) de una línea celular pulmonar humana infectada con el SARS-CoV-2 y el SARS-CoV.
• Perfiles interactómicos de ambos virus.
• Análisis de redes para proyectar datos multiómicos en redes de interacción celular.

Principales resultados:

• Se perfilaron interactomas completos para el SARS-CoV-2 y el SARS-CoV.
• Las perturbaciones inducidas por el virus se analizaron en múltiples capas moleculares (transcriptoma, proteoma, ubiquitinoma, fosfoproteoma).
• Se identificó una desregulación específica de la vía TGF-β por el SARS-CoV-2 ORF8 y la autofagia por el SARS-CoV-2 ORF3.
• El análisis de la red reveló una interconexión y mecanismos moleculares distintos / comunes entre las infecciones por SARS-CoV-2 y SARS-CoV.
• Se identificaron posibles objetivos farmacológicos, incluidos los inhibidores de la quinasa y la metaloproteasa de matriz, con potentes efectos antivirales.

Conclusiones:

• El estudio proporciona un conjunto de datos multi-ómicos integrados para comprender la patogénesis del SARS-CoV-2 y el SARS-CoV.
• Se aclararon los mecanismos moleculares distintos y comunes empleados por estos virus.
• Los hallazgos destacan las posibles estrategias terapéuticas, incluida la orientación hacia vías específicas y la identificación de medicamentos existentes con actividad antiviral.