Oncología de precisión mediada por letalidad sintética a través del transcriptoma tumoral

Área de la Ciencia:

• En el campo de la oncología
• La genómica
• Biología computacional

Sus antecedentes:

• La oncología de precisión se centra actualmente en las mutaciones en los genes impulsores del cáncer.
• La exploración del transcriptoma tumoral ofrece nuevas vías para guiar el tratamiento de pacientes con cáncer.
• Las interacciones genéticas dentro de los tumores son cada vez más reconocidas como cruciales para la respuesta terapéutica.

Objetivo del estudio:

• Introducir SELECT (letalidad sintética y oncología de precisión mediada por rescate a través del transcriptoma), un nuevo marco para predecir la respuesta al tratamiento del cáncer.
• Aprovechar los datos del transcriptoma tumoral y las interacciones genéticas para mejorar la selección del tratamiento.
• Validar el marco SELECT en diversos tipos de cáncer y ensayos clínicos.

Principales métodos:

• Desarrollo del marco SELECT que integra las interacciones genéticas y los datos del transcriptoma.
• Aplicación de SELECT para analizar los datos de 35 ensayos clínicos publicados de terapia dirigida e inmunológica.
• Probando el rendimiento predictivo de SELECT en 10 tipos diferentes de cáncer.
• Validación utilizando los datos del ensayo multi-brazo WINTHER.

Principales resultados:

• SELECT demostró capacidad predictiva en el 80% de los ensayos clínicos analizados.
• El marco predijo con éxito la respuesta del paciente en el ensayo WINTHER.
• Se generaron firmas predictivas y un código de análisis que se puso a disposición del público.

Conclusiones:

• SELECT proporciona un método sólido para predecir la respuesta del paciente a las terapias contra el cáncer utilizando datos del transcriptoma tumoral.
• El marco mejora la precisión de la oncología al incorporar interacciones genéticas.
• La disponibilidad pública de SELECT apoya nuevas investigaciones y estudios clínicos prospectivos en el tratamiento personalizado del cáncer.