Video Experimental Relacionado
Updated: Nov 9, 2025
10:40
CRISPR Gene Editing Tool for MicroRNA Cluster Network Analysis
Published on: April 25, 2022
2.6K
Transcriptómica de tejidos a escala de población mapea ARN largos no codificantes a enfermedades complejas
Olivia M de Goede1, Daniel C Nachun2, Nicole M Ferraro3
1Department of Genetics, Stanford University, Stanford, CA 94305, USA.
Cell
|April 17, 2021
Resumen
Los investigadores identificaron genes de ARN largo no codificante (ARNlnc) asociados a la enfermedad utilizando datos genéticos y de expresión génica. Muchos de los enlaces de rasgos genéticos del lncRNA identificados fueron independientes de los genes codificadores de proteínas, revelando nuevos conocimientos biológicos.
Área de la Ciencia:
- La genómica
- Biología molecular
- La bioinformática
Sus antecedentes:
- Los ARN largos no codificantes (ARNlnc) juegan un papel crucial en las funciones celulares.
- Identificar los lncRNA relevantes para la enfermedad entre miles sigue siendo un desafío.
Objetivo del estudio:
- Caracterizar sistemáticamente los genes de lncRNA para la enfermedad y la relevancia del rasgo.
- Para perfilar la expresión, la regulación genética, los contextos celulares y las asociaciones de rasgos de los lncRNA.
Principales métodos:
- Datos del proyecto de expresión de tejidos de genotipo (GTEx) v8 utilizados.
- Se han analizado datos genéticos y transcriptómicos de varios tejidos para 14.100 genes de ARNl.
- Se examinaron asociaciones en 49 tejidos y 101 rasgos genéticos complejos.
Principales resultados:
- Se identificaron 1.432 asociaciones entre genes y rasgos de ARNl.
- Encontró 800 asociaciones independientes de los efectos más fuertes de los genes codificadores de proteínas vecinos.
- Loci de rasgos cuantitativos de lncRNA vinculados a la enfermedad inflamatoria intestinal, la diabetes y la enfermedad arterial coronaria; se encontraron asociaciones de variantes raras con el índice de masa corporal.
Conclusiones:
- Este estudio proporciona un recurso completo para las asociaciones de rasgos genéticos de lncRNA.
- Destaca la contribución independiente de los lncRNA a las características y enfermedades humanas complejas.
- Ofrece nuevas vías para entender la base genética de las enfermedades comunes.
Videos de Conceptos Relacionados
02:39lncRNA - Long Non-coding RNAs
3.1K
3.1K
02:39lncRNA - Long Non-coding RNAs
9.3K
In humans, more than 80% of the genome gets transcribed. However, only around 2% of the genome codes for proteins. The remaining part produces non-coding RNAs which includes ribosomal RNAs, transfer RNAs, telomerase RNAs, and regulatory RNAs, among other types. A large number of regulatory non-coding RNAs have been classified into two groups depending upon their length – small non-coding RNAs, such as microRNA, which are less than 200 nucleotides in length, and long non-coding RNA...
9.3K
03:21RNA-seq
10.9K
RNA sequencing, or RNA-Seq, is a high-throughput sequencing technology used to study the transcriptome of a cell. Transcriptomics helps to interpret the functional elements of a genome and identify the molecular constituents of an organism. Additionally, it also helps in understanding the development of an organism and the occurrence of diseases.
Before the discovery of RNA-seq, microarray-based methods and Sanger sequencing were used for transcriptome analysis. However, while...
Before the discovery of RNA-seq, microarray-based methods and Sanger sequencing were used for transcriptome analysis. However, while...
10.9K
02:24Ribosome Profiling
3.8K
Ribosome profiling or ribo-sequencing is a deep sequencing technique that produces a snapshot of active translation in a cell. It selectively sequences the mRNAs protected by ribosomes to get an insight into a cell’s translation landscape at any given point in time.
Applications of ribosome profiling
Ribosome profiling has many applications, including in vivo monitoring of translation inside a particular organ or tissue type and quantifying new protein synthesis levels.
The technique...
Applications of ribosome profiling
Ribosome profiling has many applications, including in vivo monitoring of translation inside a particular organ or tissue type and quantifying new protein synthesis levels.
The technique...
3.8K