Enfoque químico de la proteómica para perfilar el interactoma NAD

Área de la Ciencia:

• La bioquímica
• Biología Química
• Proteomía

Sus antecedentes:

• El dinucleótido de nicotinamida adenina (NAD+) es crucial para el metabolismo y sirve como sustrato para enzimas como las polimerasas poli-ADP-ribosa (PARP).
• El alcance completo de las interacciones NAD+, conocido como el interactoma NAD, es probablemente subestimado debido a la falta de herramientas químicas efectivas para su exploración.

Objetivo del estudio:

• Diseñar, sintetizar y validar nuevas sondas de etiquetado de fotoafinidad (PAL) para perfilar las proteínas que se unen al NAD+.
• Para identificar nuevos componentes del interactoma NAD utilizando estas herramientas químicas.

Principales métodos:

• Desarrollo de sondas PAL clictables, específicamente 2- y 6-ad-BAD, basadas en NAD+.
• Aplicación de las sondas en experimentos de proteómica química para identificar las proteínas que se unen al NAD+.
• Etiquetado dependiente de los rayos UV de las proteínas por la sonda 2-ad-BAD.

Principales resultados:

• La sonda 2-ad-BAD demostró un etiquetado eficiente y dependiente de los rayos UV de los PARP.
• Los estudios proteómicos que utilizan 2- y 6-ad-BAD identificaron proteínas de unión NAD+/NADH conocidas anteriormente y nuevas.
• Validación de la utilidad de las sondas en la interrogación del interactoma NAD.

Conclusiones:

• Las sondas PAL clicables desarrolladas, 2- y 6-ad-BAD, son herramientas efectivas para investigar el interactoma NAD.
• Estas sondas facilitan el descubrimiento de nuevas proteínas de unión al NAD+, avanzando en la comprensión de las funciones del NAD+ en los procesos celulares.