Un atlas de una sola célula de la accesibilidad de la cromatina en el genoma humano

Área de la Ciencia:

• La genómica
• La epigenética
• Biología humana

Sus antecedentes:

• Los catálogos de secuencias reguladoras del genoma humano existentes son incompletos y carecen de especificidad de tipo celular.
• Comprender la regulación génica en diversos tipos de células humanas es crucial para interpretar rasgos y enfermedades complejas.

Objetivo del estudio:

• Crear mapas completos de la actividad del elemento regulador de genes en los tejidos humanos adultos y fetales.
• Determinar la especificidad de tipo celular de los elementos cisreguladores candidatos (cCREs).
• Interpretar las variantes genéticas no codificantes asociadas con los rasgos y enfermedades humanas.

Principales métodos:

• Se aplicaron ensayos de accesibilidad de la cromatina unicelular a 30 tipos de tejidos humanos adultos.
• Datos integrados con 15 tipos de tejidos fetales para un análisis combinado.
• Analizó la accesibilidad de la cromatina en más de 1,3 millones de núcleos en 222 tipos celulares distintos.

Principales resultados:

• Se ha mapeado la cromatina abierta para aproximadamente 1,2 millones de cCREs en 222 tipos de células humanas.
• Se delineó la actividad específica del tipo celular de los cCREs humanos fetales y adultos.
• Proporcionó un recurso para interpretar variantes no codificantes relacionadas con rasgos y enfermedades humanas complejas.

Conclusiones:

• Este estudio establece un recurso fundamental para analizar los programas reguladores de genes en todo tipo de células humanas, tejidos y etapas de la vida.
• Los mapas de accesibilidad de la cromatina generados mejoran nuestra comprensión del desarrollo humano y los mecanismos de la enfermedad.
• Los datos facilitan la interpretación de las variaciones genéticas en regiones no codificantes del genoma humano.