Una línea de tiempo a nivel de especie de la evolución de los mamíferos que integra datos filogenómicos

Área de la Ciencia:

• Biología evolutiva
• La genómica
• Biología computacional

Sus antecedentes:

• La secuenciación de alto rendimiento genera vastos datos del genoma para filogenias.
• Los métodos actuales de árbol de tiempo bayesiano son computacionalmente limitados, lo que dificulta el análisis de grandes conjuntos de datos.
• Los análisis del reloj molecular de los mamíferos arrojan estimaciones de edad contradictorias y grandes incertidumbres.

Objetivo del estudio:

• Desarrollar un enfoque de datación de reloj molecular bayesiano para conjuntos de datos filogenómicos a gran escala.
• Estimar un árbol de tiempo para 4.705 especies de mamíferos utilizando 72 genomas de mamíferos.
• Mejorar la precisión de las estimaciones de tiempo de diversificación para probar las hipótesis macroevolutivas.

Principales métodos:

• Desarrolló un nuevo enfoque de datación de reloj molecular bayesiano.
• Datos integrados de 72 genomas de mamíferos para 4.705 especies.
• Aplicó el método para inferir un árbol de tiempo completo de mamíferos.

Principales resultados:

• Demostró que los conjuntos de datos filogenómicos más grandes reducen la incertidumbre en las estimaciones de tiempo de diversificación.
• Rechazó con confianza un modelo explosivo del origen de los mamíferos placentarios en el Paleógeno.
• Dató el origen de la corona Placentalia al Cretácico Tardío con una clara diversificación ordinal en el Paleoceno/Eoceno.

Conclusiones:

• La nueva metodología bayesiana permite el análisis de genomas completos y miles de especies.
• Este enfoque aborda cuestiones de investigación anteriormente difíciles de resolver sobre la diversificación de las especies.
• El método es aplicable a otros casos controvertidos de diversificación animal y vegetal que requieren datos filogenómicos a nivel de especie.