La secuenciación del genoma completo revela los factores del huésped subyacentes al COVID-19 crítico

Área de la Ciencia:

• La genética
• Inmunología
• Medicina de cuidados intensivos

Sus antecedentes:

• El COVID-19 crítico es el resultado de una lesión pulmonar inflamatoria mediada por el sistema inmunológico.
• Las variaciones genéticas del huésped afectan la gravedad de la infección por SARS-CoV-2.
• El estudio GenOMICC compara los genomas de pacientes críticamente enfermos con los controles de la población.

Objetivo del estudio:

• Para identificar las variantes genéticas que predisponen a las personas al COVID-19 crítico.
• Descubrir los mecanismos subyacentes de la enfermedad y los posibles objetivos terapéuticos.

Principales métodos:

• Secuenciación de todo el genoma de 7.491 individuos críticamente enfermos y 48.400 controles.
• Análisis de la asociación y colocalización de todo el transcriptoma.
• Estudios de aleatorización mendeliana.

Principales resultados:

• Se descubrieron y replicaron 23 variantes independientes significativamente asociadas con COVID-19 crítico.
• Se identificaron 16 nuevas asociaciones, incluyendo genes en la señalización del interferón (IL10RB, PLSCR1), la diferenciación de leucocitos (BCL11A) y el estado secretor (FUT2).
• La evidencia implica cambios en la expresión génica (por ejemplo, ATP11A, MUC1) e identifica objetivos potencialmente farmacológicos (SELE, ICAM5, CD209, F8).

Conclusiones:

• Los factores genéticos juegan un papel crucial en la patogénesis severa del COVID-19.
• Dos mecanismos principales contribuyen a la enfermedad que pone en peligro la vida: el control viral deteriorado o el aumento de la inflamación / coagulación.
• La comparación de casos de enfermedad crítica con controles es efectiva para encontrar objetivos terapéuticos.