El genotipado basado en REVEALR de las variantes de preocupación del SARS-CoV-2 en muestras clínicas

Área de la Ciencia:

• Biología molecular
• Virología
• Biotecnología

Sus antecedentes:

• Las variantes emergentes de SARS-CoV-2 plantean desafíos significativos para la salud pública debido al aumento de la transmisibilidad y la evasión inmune.
• La necesidad de herramientas de diagnóstico rápidas, precisas y accesibles para la identificación de cepas virales es crítica.
• Los métodos existentes pueden no ser suficientes para el monitoreo en tiempo real de poblaciones virales en rápida evolución.

Objetivo del estudio:

• Desarrollar y validar un nuevo ensayo de genotipo para la detección rápida de las principales cepas de SARS-CoV-2.
• Adaptar el sistema REVEALR (reporter analítico de ácido nucleico viral codificado por ARN) para la detección del polimorfismo de un solo nucleótido en el SARS-CoV-2.

Principales métodos:

• Diseño de un ensayo REVEALR basado en la enzima ADN para la detección del desajuste de una sola base.
• Prueba del ensayo en 34 muestras clínicas de pacientes recolectadas en 2021.
• Genotipado de las variantes del SARS-CoV-2 que incluyen Wuhan-Hu-1, Alpha, Gamma, Epsilon, Delta y Omicron.

Principales resultados:

• El ensayo de genotipado REVEALR logró una precisión del 100% en la identificación de todas las variantes de SARS-CoV-2 probadas.
• El sistema demostró una alta sensibilidad y especificidad frente a muestras clínicas derivadas de pacientes.
• Detección exitosa de desajustes de una sola base correspondientes a las principales cepas que circulan en los Estados Unidos.

Conclusiones:

• El sistema REVEALR proporciona un método altamente preciso y rápido para el genotipado de la variante del SARS-CoV-2.
• Este ensayo programable y multiplejable representa un avance significativo en el diagnóstico personalizado.
• La tecnología ofrece una herramienta valiosa para la vigilancia de la salud pública y la respuesta a las amenazas virales emergentes.