Las secuencias de 150.119 genomas en el Biobanco del Reino Unido

Área de la Ciencia:

• La genómica
• La genética humana
• Genética de las poblaciones

Sus antecedentes:

• Comprender la diversidad fenotípica humana requiere caracterizar la secuencia genómica y la variación fenotípica.
• Las ideas anteriores provinieron de la secuenciación de exomas enteros o de genomas enteros de grandes cohortes con ricos datos fenotípicos.
• Los estudios genómicos a gran escala a menudo excluyen variantes estructurales y microsatélites.

Objetivo del estudio:

• Para analizar los datos de secuenciación de todo el genoma de 150,119 participantes del Biobanco del Reino Unido.
• Caracterizar la variación de la secuencia y su impacto en los rasgos dentro de diversas poblaciones.
• Identificar nuevas asociaciones de rasgos para las variantes raras.

Principales métodos:

• Secuenciación de todo el genoma de 150.119 individuos.
• Análisis de polimorfismos de un solo nucleótido (SNP), indels, variantes estructurales y microsatélites.
• Análisis del rango de agotamiento para caracterizar la conservación y selección de la secuencia.
• Panel de referencia del haplotipo para la imputación de variantes.

Principales resultados:

• Generó un conjunto de datos de alta calidad de más de 585 millones de SNPs y 58 millones de indels.
• Se han identificado 895.055 variantes estructurales y 2.536.688 microsatélites.
• El análisis de rango de agotamiento indicó que los exones codificantes son una pequeña fracción de las regiones genómicas conservadas.
• Descubrió nuevas asociaciones de rasgos para variantes raras con grandes efectos.

Conclusiones:

• Los datos de secuenciación del genoma completo del Biobanco del Reino Unido proporcionan un recurso completo para estudios de variación genética humana.
• Este recurso permite la caracterización de las presiones de selección en todo el genoma.
• Se han identificado nuevas asociaciones de rasgos para variantes raras, avanzando en nuestra comprensión de las relaciones genotipo-fenotipo.