Cronología profunda de todo el genoma ctDNA del cáncer de próstata resistente al tratamiento

Área de la Ciencia:

• La genómica
• Biología del cáncer
• Oncología molecular

Sus antecedentes:

• El análisis de ADN tumoral circulante (ctDNA) es una herramienta prometedora para el genotipo y el monitoreo del cáncer.
• Los estudios anteriores que utilizan enfoques dirigidos han limitado nuestra comprensión de la heterogeneidad del ctDNA.
• El cáncer de próstata agresivo presenta desafíos complejos para el tratamiento y el seguimiento.

Objetivo del estudio:

• Analizar exhaustivamente las alteraciones genómicas dentro del ADN ct de pacientes con cáncer de próstata agresivo.
• Para investigar la dinámica evolutiva de las distintas poblaciones de ctDNA.
• Identificar los factores genómicos de la resistencia adquirida a los inhibidores de la vía del receptor de andrógenos (AR).

Principales métodos:

• Secuenciación profunda de todo el genoma de ADNc de plasma en serie y metástasis sincrónicas.
• Evaluación integral de todas las clases de alteraciones genómicas.
• Análisis del ctDNA antes y después del tratamiento con inhibidores de la vía AR.
• Inferencia de la expresión del ARNm y la actividad del factor de transcripción a partir de las huellas nucleosómicas del ADN ct.

Principales resultados:

• El ctDNA alberga múltiples poblaciones dominantes con historias evolutivas distintas, incluida la duplicación de todo el genoma y los cambios en los procesos mutacionales.
• Concordancia de las alteraciones del conductor clonal entre el tejido y el ADNc, con metástasis individuales que contribuyen mínimamente al ADNc total.
• La resistencia adquirida a los inhibidores de la vía AR es impulsada principalmente por el aumento de la AR.
• Las huellas nucleosómicas en el ADN ct inferían con precisión la expresión del ARNm y la actividad de señalización de AR en las metástasis.

Conclusiones:

• El análisis de ctDNA proporciona una visión profunda de la evolución y la heterogeneidad del cáncer.
• La biopsia líquida permite un descubrimiento multi-ómico completo, incluida la expresión génica y la actividad de la vía de señalización.
• Comprender la dinámica del ctDNA es crucial para monitorear la respuesta al tratamiento e identificar los mecanismos de resistencia en el cáncer de próstata.