Taxonomía molecular específica de África para el cáncer de próstata

Área de la Ciencia:

• La genómica
• Investigación del cáncer
• Genética de las poblaciones

Sus antecedentes:

• El cáncer de próstata exhibe importantes disparidades geoétnicas, con tasas de mortalidad más altas en el África subsahariana.
• Los factores genéticos y no genéticos que contribuyen a estas disparidades, junto con los procesos de mutación asociados, siguen siendo en gran medida desconocidos.
• La ascendencia africana es un factor de riesgo reconocido para el cáncer de próstata.

Objetivo del estudio:

• Generar un recurso completo de genómica del cáncer para el África subsahariana.
• Para identificar las alteraciones genéticas específicas de la ascendencia y las firmas mutacionales en el cáncer de próstata.
• Establecer una taxonomía molecular del cáncer de próstata basada en la ascendencia y los procesos mutacionales.

Principales métodos:

• Secuenciación del genoma completo de 183 muestras de cáncer de próstata no tratadas de pacientes de ascendencia africana y europea.
• Identificación y análisis de aproximadamente 2 millones de variantes somáticas.
• La inclusión de datos asiáticos chinos para definir y validar los subtipos mutacionales globales (GMS).

Principales resultados:

• Descubrimiento de hallazgos significativos específicos de la ascendencia africana, incluida una carga mutacional tumoral elevada, una mayor alteración del genoma y genes impulsores específicos (NCOA2, STK19, DDX11L1, PCAT1, SETBP1).
• Desarrollo de una taxonomía molecular para el cáncer de próstata definida por subtipos mutacionales globales (GMS) diferenciados por ascendencia.
• Identificación de GMS-B y GMS-D como específicos de las poblaciones africanas, GMS-A como universal y GMS-C (pérdidas de número de ejemplares) como restringidas a las poblaciones africanas europeas y predictivas de malos resultados.

Conclusiones:

• Los subtipos mutacionales globales revelan trayectorias evolutivas y procesos mutacionales distintos en el cáncer de próstata.
• Tanto los factores genéticos comunes como los ambientales probablemente contribuyen a las disparidades étnicas observadas en el cáncer de próstata.
• Los hallazgos subrayan la importancia de incluir diversos ancestros en los estudios de genómica del cáncer y sugieren que los subtipos de GMS pueden servir como un sustituto de los procesos mutacionales intrínsecos y extrínsecos.