Un mapa saturado de variantes genéticas comunes asociadas con la altura humana

Área de la Ciencia:

• La genética humana
• La genómica
• Genética estadística

Sus antecedentes:

• Los polimorfismos comunes de un solo nucleótido (SNP) contribuyen significativamente a la variación de la altura humana.
• La identificación de variantes específicas asociadas a la altura requiere estudios de asociación a gran escala en todo el genoma (GWAS).

Objetivo del estudio:

• Identificar SNPs independientes asociados con la altura humana y mapear sus ubicaciones genómicas.
• Evaluar la heredabilidad explicada por estos SNPs en diversas ascendencias.
• Investigar la relación entre la densidad de SNP, el enriquecimiento genético y las vías biológicas.

Principales métodos:

• Se llevó a cabo un GWAS en 5,4 millones de individuos de diversas ascendencias.
• Se identificaron 12.111 SNPs independientes significativamente asociados con la altura.
• Se analizó el agrupamiento de SNP, las características del segmento genómico y el enriquecimiento de genes.
• Precisión de predicción evaluada en conjuntos de datos fuera de la muestra en diferentes ascendencias.

Principales resultados:

• 12.111 SNPs independientes representan casi toda la heredabilidad común de la altura basada en el SNP.
• Estos SNPs se agrupan en 7.209 segmentos genómicos, enriquecidos con genes biológicamente relevantes.
• La predicción de la variación de altura basada en el SNP es alta en la ascendencia europea (40-45%) pero más baja en otras ascendencias (10-24%).
• La precisión reducida de la predicción en las ascendencias no europeas se atribuye al desequilibrio de enlace y a las diferencias en la frecuencia de alelos.

Conclusiones:

• Se establece un mapa completo de variantes comunes asociadas a la altura, en gran medida saturado para la ascendencia europea.
• Las vías biológicas se pueden detectar con tamaños de muestra más pequeños que las variantes causales.
• Se necesita más investigación para lograr una saturación genómica equivalente para las variantes asociadas a la altura en los antepasados no europeos.