Alteración del genoma 3D específica del subtipo en la leucemia mieloide aguda

Área de la Ciencia:

• La genómica
• Biología del cáncer
• La epigenética

Sus antecedentes:

• La leucemia mieloide aguda (LMA) es un cáncer de sangre complejo caracterizado por mutaciones genéticas.
• El papel de las alteraciones de la estructura del genoma 3D en la patogénesis de la LMA sigue siendo en gran medida desconocido.

Objetivo del estudio:

• Investigar el impacto de las mutaciones asociadas a la LMA en la arquitectura tridimensional de la cromatina.
• Identificar nuevos elementos y circuitos regulatorios que contribuyan al desarrollo y la progresión de la lucha contra el blanqueo de capitales.

Principales métodos:

• Hi-C y secuenciación de todo el genoma en muestras de pacientes con LMA y donantes sanos.
• Secuenciación de ARN, ATAC-seq y CUT&Tag para las marcas epigenéticas (CTCF, H3K27ac, H3K27me3).
• Validación funcional basada en CRISPR y secuenciación de bisulfito de todo el genoma.

Principales resultados:

• Se han identificado alteraciones recurrentes y específicas del subtipo en los compartimentos A/B, TAD y bucles de cromatina en la LMA.
• Se descubrieron bucles promotor-potenciador y promotor-silenciador específicos de la LMA, con funciones validadas en la regulación génica.
• Se revelaron eventos de secuestro de potenciadores y silenciadores inducidos por variaciones estructurales que afectan el crecimiento celular de la LMA y la expresión génica.

Conclusiones:

• Las alteraciones del genoma 3D son factores significativos en la leucemia mieloide aguda.
• Los bucles represivos y los elementos cis-reguladores secuestrados representan objetivos terapéuticos potenciales en la LMA.
• La metilación del ADN, la unión CTCF y la estructura del genoma 3D están intrincadamente vinculadas y son manipulables en la LMA.