Efecto de la microbiota intratumoral en la heterogeneidad espacial y celular en el cáncer

Área de la Ciencia:

• En el campo de la oncología
• Microbiología
• La genómica

Sus antecedentes:

• La microbiota asociada al tumor es un componente clave del microambiente tumoral.
• Los estudios anteriores se basaron en el análisis de tejidos a granel, oscureciendo la distribución espacial de la microbiota y los efectos localizados.

Objetivo del estudio:

• Para revelar las interacciones espaciales, celulares y moleculares entre huésped y microbios dentro de los tumores utilizando perfiles espaciales avanzados y secuenciación de una sola célula.
• Comprender la distribución organizada y el impacto funcional de la microbiota intratumoral.

Principales métodos:

• Transcriptómica espacial adaptada 10x de Visium para la identificación y localización de la comunidad microbiana in situ.
• Utilizó el perfil espacial digital GeoMx para analizar las características del nicho bacteriano.
• Desarrolló y aplicó INVADEseq (secuenciación de expresión dirigida por invasión-adhesión) para el análisis de la interacción huésped-microbio de una sola célula.

Principales resultados:

• Se encontraron comunidades bacterianas en micronichas menos vascularizadas e inmunosupresoras asociadas con células malignas que exhibían niveles más bajos de Ki-67.
• Identificó bacterias asociadas a células y células huésped que interactúan, revelando vías alteradas en la inflamación, la metástasis, la latencia y la reparación del ADN.
• Demostró que las células cancerosas infectadas con bacterias invaden individualmente y reclutan células mieloides, promoviendo la progresión del tumor.

Conclusiones:

• La distribución de la microbiota intratumoral está altamente organizada dentro de micronichos específicos.
• Estas micronichas enriquecidas con microbiota poseen funciones inmunológicas y epiteliales que promueven activamente la progresión del cáncer.