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Updated: Aug 16, 2025

11:13
Mass Spectrometry-Guided Genome Mining as a Tool to Uncover Novel Natural Products
Published on: March 12, 2020
11.0K
La edición de bases múltiple permite la regulación epigenética combinatoria para la minería del genoma de productos
Fanglong Zhao1, Chunxiao Sun1, Zhiwen Liu1
1Department of Chemical and Biomolecular Engineering, Rice University, Houston, Texas 77005, United States.
Journal of the American Chemical Society
|December 21, 2022
Resumen
Los investigadores desarrollaron una plataforma de edición de bases múltiple (MBE, por sus siglas en inglés) para la manipulación eficiente del genoma de hongos. Esta herramienta permitió el descubrimiento de nuevos productos naturales (NPs) mediante la activación de grupos de genes crípticos en Aspergillus nidulans.
Área de la Ciencia:
- Biología sintética
- Descubrimiento de productos naturales
- Genómica de hongos
Sus antecedentes:
- La minería del genoma para productos naturales (NPs) en hongos filamentosos se ve obstaculizada por una regulación genética compleja.
- Las modificaciones epigenéticas influyen en la transcripción de genes fúngicos, pero la manipulación simultánea de múltiples genes es limitada.
Objetivo del estudio:
- Desarrollar una nueva plataforma para la manipulación eficiente y de alto rendimiento del genoma de hongos.
- Para permitir la activación de grupos de genes crípticos para el descubrimiento de nuevos NPs.
Principales métodos:
- Desarrollo de una plataforma de edición de bases múltiple (MBE) para la inactivación simultánea de hasta ocho genes.
- Aplicación de MBE para inactivar combinatoriamente tres reguladores epigenéticos negativos en *Aspergillus nidulans*.
- Análisis de grupos de genes activados para la identificación de nuevos NPs.
Principales resultados:
- La plataforma MBE demostró una alta capacidad y rendimiento para la manipulación del genoma de hongos.
- La inactivación combinada de los reguladores epigenéticos activó ocho grupos de genes crípticos.
- Identificación de nuevos PN con estructuras químicas híbridas únicas de cicorina y poliamina.
Conclusiones:
- La plataforma MBE escalable y eficiente avanza significativamente en la manipulación del genoma de hongos.
- Este enfoque facilita la minería del genoma de nuevos NPs de hongos filamentosos.
- La plataforma MBE ofrece una poderosa estrategia para explotar la diversidad química de los hongos.

