Un atlas del factor de transcripción de la diferenciación dirigida

Área de la Ciencia:

• Biología molecular
• La genómica
• Biología de las células madre

Sus antecedentes:

• Los factores de transcripción (TF) son reguladores clave de la expresión génica, que controlan los procesos y estados celulares.
• Comprender la capacidad funcional completa de los TF es crucial para el control y la ingeniería del estado de la célula.

Objetivo del estudio:

• Para crear un recurso completo, el Atlas TF, que trace los perfiles de expresión inducidos por todas las isoformas de empalme TF humanas.
• Para permitir la generación precisa de tipos celulares, el modelado de enfermedades y acelerar los esfuerzos de ingeniería celular.

Principales métodos:

• Desarrolló una biblioteca de códigos de barras de más de 3.500 isoformas de empalme de TF humanos.
• Aplicó la biblioteca a las células madre embrionarias humanas (hESC) para el perfil de expresión de una sola célula (TF Atlas).
• Datos integrados de la expresión del ARNm y de la accesibilidad de la cromatina; modelos predictivos desarrollados para combinaciones de TF.

Principales resultados:

• Perfiles de expresión inducidos por TF asignados a los tipos de células de referencia.
• TFs validados para generar diversos tipos de células en las tres capas germinales y trofoblastos.
• Creó un modelo de enfermedad celular e identificó reguladores genéticos posteriores.

Conclusiones:

• El Atlas TF proporciona una poderosa plataforma para comprender las funciones de TF y dirigir el destino celular.
• Este recurso acelera la ingeniería de tipos celulares específicos y el desarrollo de modelos de enfermedades.