Bases estructurales para la selección del sustrato por la replicasa del SARS-CoV-2

Área de la Ciencia:

• Biología estructural
• Virología
• Descubrimiento de drogas

Sus antecedentes:

• La ARN polimerasa dependiente del ARN del SARS-CoV-2 (RdRp) forma el complejo de replicación-transcripción (RTC), un objetivo clave para los medicamentos antivirales como el remdesivir.
• Comprender cómo el RTC selecciona los trifosfatos nucleótidos (NTP) para la síntesis del ARN viral y cómo compiten los antivirales es crucial para desarrollar inhibidores efectivos.

Objetivo del estudio:

• Aclarar los mecanismos estructurales por los cuales el RTC del SARS-CoV-2 reconoce los NTP naturales e incorpora análogos de nucleósidos antivirales.
• Proporcionar una base estructural para la incorporación selectiva de remdesivir trifosfato (RDV-TP) sobre el trifosfato de adenosina (ATP).

Principales métodos:

• Se empleó microscopía electrónica criogénica (cryo-EM) para visualizar el RTC en complejo con NTPs naturales y RDV-TP.
• El análisis estructural se centró en las interacciones que rigen la unión y la incorporación de nucleótidos.

Principales resultados:

• Se obtuvieron estructuras detalladas de los RTC vinculados a los NTP naturales en los estados previos a la incorporación.
• Se reveló la base estructural para la incorporación selectiva de RDV-TP, diferenciándola del ATP.
• Se caracterizó el reconocimiento de nucleótidos por el dominio de NiRAN nsp12, incluida la unión selectiva de trifosfato de guanosina (GTP).

Conclusiones:

• Los hallazgos explican las interacciones moleculares esenciales para el reconocimiento de NTP por el RTC, informando el diseño racional de nuevos agentes antivirales.
• Los conocimientos sobre la función del dominio NiRAN apoyan su papel en la formación de la capa de ARN 5', crucial para la propagación viral.