Seguimiento de los cambios de estado de la cromatina mediante el etiquetado de fotoproximidad a nanoescala

Área de la Ciencia:

• La bioquímica
• Biología molecular
• Biología Química

Sus antecedentes:

• Los procesos celulares dependen de las interacciones biomoleculares, cruciales para el destino celular.
• Las interacciones alteradas pueden conducir a enfermedades o efectos terapéuticos.
• El mapeo de las interacciones entre proteínas nucleares es un desafío debido a la baja abundancia, la unión transitoria y las limitaciones tecnológicas.

Objetivo del estudio:

• Desarrollar un nuevo método para mapear las interacciones entre proteínas nucleares.
• Investigar los cambios en los interactomas nucleares en respuesta a las mutaciones del cáncer y los tratamientos farmacológicos.

Principales métodos:

• Incorporación sin rastro de fotosensibilizadores de iridio en el núcleo utilizando inteínas divididas por ingeniería.
• Activación de las ojivas de diazirina a través de la transferencia de energía de Dexter para formar carbenos reactivos.
• Etiquetado de proximidad a nanoescala (μMap) para el enlace cruzado y el análisis quimioproteómico cuantitativo.

Principales resultados:

• μMap mapea con éxito las interacciones entre proteínas nucleares dentro de un radio de ~ 10 nm.
• El método reveló cambios críticos en los interactomas asociados con mutaciones cancerosas.
• μMap identificó interacciones alteradas tras el tratamiento con inhibidores de moléculas pequeñas.

Conclusiones:

• μMap proporciona una herramienta poderosa para comprender las interacciones entre proteínas nucleares.
• Esta técnica mejora la comprensión fundamental de los microambientes nucleares.
• Se espera que μMap tenga un impacto significativo en el descubrimiento de fármacos epigenéticos en el mundo académico y la industria.