Descubrimiento de genes objetivo y vías en los loci GWAS mediante pantallas CRISPR de una sola célula agrupadas

Área de la Ciencia:

• La genómica
• Biología molecular
• La genética

Sus antecedentes:

• Los estudios de asociación de todo el genoma (GWAS) identifican variantes genéticas asociadas con rasgos y enfermedades complejas.
• La mayoría de las variantes identificadas se encuentran en regiones no codificantes con efectos funcionales desconocidos.

Objetivo del estudio:

• Identificar los genes objetivo de las variantes no codificantes de GWAS.
• Aclarar los mecanismos por los que las variantes no codificantes influyen en la expresión génica y los rasgos complejos.

Principales métodos:

• Se utilizaron datos GWAS a escala de biobanco y de diversidad ancestral.
• Utilizó pantallas CRISPR masivas y paralelas y secuenciación transcriptómica / proteómica de una sola célula.
• Se utiliza la edición de bases para la inserción precisa de variantes para vincular las variantes con cambios en la expresión génica.

Principales resultados:

• Descubrió 124 genes cis-objetivo para 91 loci GWAS de rasgos sanguíneos no codificantes.
• Se han identificado redes de efecto trans de loci no codificantes que influyen en los factores de transcripción o en los microARN.
• Contribuciones poligénicas demostradas a rasgos complejos a través de estas redes.

Conclusiones:

• Desarrolló una plataforma para la caracterización masiva paralela de objetivos y mecanismos de variantes no codificantes.
• Variantes no codificantes específicas conectadas a cambios en la expresión génica y redes de rasgos complejos.
• Proporcionó información sobre los efectos cis y trans de las variantes no codificantes en la enfermedad humana.