Retrotransposición somática generalizada en el epitelio colorrectal normal

Área de la Ciencia:

• La genómica
• Biología molecular
• La epigenética

Sus antecedentes:

• Las alteraciones genómicas se acumulan en las células somáticas durante toda la vida.
• El papel de la retrotransposición del elemento nuclear-1 (L1) intercalado largo en los paisajes de mutación celular normales se entiende mal.

Objetivo del estudio:

• Investigar las secuencias de todo el genoma de clones unicelulares para comprender la retrotransposición somática L1 en células normales.
• Identificar la velocidad, las características y la regulación de los eventos de retrotransposición L1 en diferentes tipos de células y edades.

Principales métodos:

• Secuenciación de todo el genoma de 899 clones de una sola célula de 28 individuos.
• Identificación y análisis de los eventos de retrotransposición somática L1.
• Impresión digital de los elementos de origen L1 y análisis multidimensional de la actividad de retrotransposición.

Principales resultados:

• Se identificaron 1.708 eventos somáticos de retrotransposición L1, enriquecidos en el epitelio colorrectal y correlacionados con la edad.
• Las retrotransposiciones somáticas L1 ocurren desde la embriogénesis temprana, con regulación epigenética establecida durante la organogénesis.
• Las L1 competentes para la retrotransposición con frecuencias aleloides más bajas mostraron una mayor actividad, y solo una fracción de las transcripciones de L1 fueron retrotranspuestas.

Conclusiones:

• La retrotransposición somática L1 contribuye al mosaicismo en las células normales a lo largo de la vida humana.
• Las tasas de retrotransposición L1 aumentan significativamente durante la tumorigénesis colorrectal.
• Este estudio proporciona información sobre la regulación genómica y epigenómica de los elementos transponibles.