La precisión de la puntuación poligénica varía en todo el continuo de ascendencia genética

Área de la Ciencia:

• La genética
• La bioinformática
• Salud de la población

Sus antecedentes:

• Las puntuaciones poligénicas (PGS) son cruciales para predecir el riesgo de enfermedad, pero enfrentan desafíos en la portabilidad entre diversas poblaciones.
• Las evaluaciones actuales de la portabilidad de PGS a menudo pasan por alto las variaciones individuales dentro de las poblaciones.
• La aplicación equitativa de los SGP se ve obstaculizada por su limitada generalización.

Objetivo del estudio:

• Investigar el impacto de la distancia genética en la precisión de la puntuación poligénica en diversos antepasados.
• Evaluar la eficacia de una medida continua de la distancia genética frente a grupos discretos de ascendencia para la portabilidad de PGS.
• Identificar los factores que influyen en la variación del rendimiento de la SGP dentro y entre poblaciones.

Principales métodos:

• Se utilizaron grandes biobancos (ATLAS y UK Biobank) con diversos participantes.
• Evaluó la precisión de la PGS a través de un continuo de ancestros genéticos.
• Cuantificó la relación entre la distancia genética (GD) y la precisión de la PGS utilizando la correlación de Pearson.
• El rendimiento comparado de PGS entre individuos con ascendencia europea e hispana / latinoamericana.

Principales resultados:

• La precisión de la PGS disminuye a lo largo del continuo de las ascendencias genéticas, incluso dentro de grupos aparentemente homogéneos.
• La distancia genética (GD) se correlaciona fuertemente con la precisión de la PGS (r = -0.95) en 84 rasgos.
• Los individuos con una mayor distancia genética de los datos de entrenamiento exhiben una precisión PGS significativamente menor.
• Los individuos hispanos/latinos más cercanos en GD a los datos de capacitación mostraron un rendimiento similar al de los individuos europeos distantes.

Conclusiones:

• El continuo de ancestros genéticos, medido por GD, es un factor crítico en la portabilidad y precisión de PGS.
• Los grupos discretos de ascendencia genética son insuficientes para evaluar e interpretar con precisión el rendimiento de la PGS.
• El desarrollo y la aplicación futuros del SGP deben tener en cuenta la naturaleza continua de la variación genética para un uso equitativo.