La espectrometría de masas de movilidad iónica revela conformaciones globales de proteínas en respuesta a condiciones que promueven y revierten la separación de fase líquido-líquido

Área de la Ciencia:

• La bioquímica
• Biología estructural
• Biología celular

Sus antecedentes:

• La separación de fase líquido-líquido (LLPS) es crucial para la organización celular, pero su vínculo con la conformación de proteínas no está claro.
• La flexibilidad de las proteínas y la oligomerización complican el estudio de los cambios conformacionales que impulsan el LLPS.

Objetivo del estudio:

• Investigar los estados conformacionales de la ubiquilina-2 (UBQLN2) durante la separación de fase líquido-líquido (LLPS).
• Para determinar cómo se relaciona la conformación de las proteínas con el LLPS de UBQLN2.

Principales métodos:

• Se utilizó la espectrometría de masas de movilidad iónica (IM-MS) para analizar el UBQLN2 de longitud completa.
• Cambios conformacionales de UBQLN2 examinados bajo diferentes concentraciones de sal y en presencia de ubiquitina (Ub).

Principales resultados:

• IM-MS mostró que UBQLN2 existe como monómeros y dímeros, con dímeros que se vuelven más extendidos a altas concentraciones de sal.
• UBQLN2 formó complejos UBQLN2/Ub 2:1 y 2:2 con estructuras compactas en comparación con los dímeros libres de UBQLN2.
• Las conformaciones extendidas de UBQLN2 se correlacionaron con la propensión de la proteína a la separación de fase.

Conclusiones:

• Los cambios conformacionales de las proteínas, específicamente los estados extendidos, están relacionados con el LLPS.
• IM-MS es eficaz para el estudio de las conformaciones dinámicas de proteínas en LLPS.
• Comprender las conformaciones relacionadas con LLPS es vital para la función celular y los mecanismos de la enfermedad.