La secuenciación ultra profunda de los cazadores-recolectores Hadza recupera los microbios intestinales que...

Área de la Ciencia:

• Investigación del microbioma
• La genómica humana
• Antropología

Sus antecedentes:

• Los datos del microbioma humano están fuertemente sesgados hacia las poblaciones industrializadas.
• Esto limita la comprensión de la diversidad microbiana en las comunidades no industrializadas.
• El microbioma intestinal juega un papel crucial en la salud inmune y metabólica.

Objetivo del estudio:

• Para caracterizar el microbioma intestinal de los cazadores-recolectores Hadza.
• Para comparar el microbioma Hadza con los de Nepal y California.
• Identificar las especies y funciones microbianas únicas de los estilos de vida no industrializados.

Principales métodos:

• Secuenciación metagenómica ultra profunda de 351 muestras fecales.
• Recuperación del genoma de bacterias, arqueas, bacteriófagos y eucariotas.
• Análisis comparativo de las comunidades microbianas en diversas poblaciones.

Principales resultados:

• Se recuperaron 91,662 genomas, con un 44% nuevo para los conjuntos de datos existentes.
• Se identificaron 124 especies residentes en el intestino como desaparecidas en poblaciones industrializadas.
• Los microbios intestinales Hadza mostraron distintas tasas de replicación, firmas de selección y compartición de cepas.
• Los microbios industrializados fueron enriquecidos con genes de estrés oxidativo, lo que sugiere una adaptación a la inflamación.

Conclusiones:

• El microbioma intestinal Hadza ofrece una ventana única a la diversidad microbiana humana.
• Los estilos de vida industrializados inducen perturbaciones significativas en el microbioma intestinal.
• Esta investigación proporciona un recurso valioso para comprender la colonización intestinal y la salud.