Los polimorfismos repetidos subyacen a los principales loci de riesgo genético para el glaucoma y el cáncer...

Área de la Ciencia:

• La genómica
• La genética humana
• Biología molecular

Sus antecedentes:

• El genoma humano contiene regiones con números variables de repeticiones en tándem (VNTR), lo que lleva a diferencias de longitud entre los individuos.
• Las consecuencias fenotípicas de estas variaciones genómicas, particularmente las VNTR, siguen siendo en gran medida no caracterizadas en todo el genoma.

Objetivo del estudio:

• Investigar el impacto fenotípico de las VNTR en todo el genoma.
• Identificar VNTRs específicos asociados con rasgos complejos y regulación génica.

Principales métodos:

• Se utilizó la imputación estadística para estimar las longitudes de 9.561 loci VNTR autosómicos en grandes cohortes (UK Biobank y GTEx).
• Se realizaron análisis de asociación y cartografía estadística fina para identificar los VNTR que influyen en los rasgos complejos y la expresión genética / empalme.

Principales resultados:

• Se identificaron 58 VNTRs que influyen en los rasgos complejos en la cohorte del Biobanco del Reino Unido.
• Se encontró que 18 de estos VNTR modulan la expresión o el empalme de genes cercanos.
• Los VNTR no codificantes en TMCO1 y EIF3H mostraron contribuciones significativas al riesgo de glaucoma y cáncer colorrectal, respectivamente, con una variación de riesgo > 2 veces mayor.

Conclusiones:

• Los VNTR desempeñan un papel sustancial y no reconocido anteriormente en la salud humana.
• Los VNTR no codificantes contribuyen significativamente a la variación genética que influye en los rasgos complejos y la regulación génica.