La compartimentación de la cromatina regula la respuesta al daño del ADN

Área de la Ciencia:

• La genómica
• Biología molecular
• Biología celular

Sus antecedentes:

• La respuesta al daño del ADN (DDR) es crucial para mantener la integridad del genoma.
• Si bien se conoce el papel de la cromatina en la reparación del ADN, el impacto del plegamiento de los cromosomas es menos entendido.

Objetivo del estudio:

• Investigar el papel del plegamiento y la compartimentación cromosómica en la respuesta al daño del ADN.
• Caracterizar la formación y la función de un nuevo compartimento de cromatina inducido por rupturas de doble cadena de ADN (DSB).

Principales métodos:

• Inducción de las DSB en las células de mamíferos.
• Análisis de la organización de la cromatina utilizando técnicas para detectar dominios topológicamente asociados dañados (TAD) y marcadores específicos (γH2AX, 53BP1).
• Investigación del mecanismo de formación de compartimientos (separación polímero-polímero frente a la fase líquido-líquido) y su regulación.

Principales resultados:

• La señalización ATM impulsa la formación de un nuevo compartimiento de cromatina (compartimiento D) mediante la agrupación de TAD dañados.
• Esta formación de compartimiento es consistente con la separación de fase de polímero-polímero y ocurre principalmente en la fase G1.
• El compartimento D mejora la activación de los genes que responden al daño del ADN enriquecidos con el bucle R, pero también aumenta las tasas de translocación.

Conclusiones:

• La compartimentación inducida por DSB orquesta la respuesta al daño del ADN.
• La arquitectura cromosómica juega un papel crítico tanto en la reparación del ADN como en la inestabilidad genómica.
• El estudio revela un nuevo mecanismo que vincula el plegamiento cromosómico con el mantenimiento del genoma y la enfermedad.