La cartografía molecular descubre dinámicas evolutivas y microambientales en tumores colorrectales esporádicos

Área de la Ciencia:

• En el campo de la oncología
• La genómica
• Inmunología

Sus antecedentes:

• El cáncer colorrectal (CRC) se caracteriza por una heterogeneidad celular y genética significativa durante la progresión maligna.
• Comprender la evolución del tumor y su microambiente es crucial para desarrollar estrategias terapéuticas efectivas.

Objetivo del estudio:

• Para crear un atlas multi-ómico espacial de la progresión del cáncer colorrectal.
• Para mapear la evolución del tumor, identificar las vías de progresión y caracterizar las alteraciones microambientales.
• Para descubrir biomarcadores asociados con la progresión del tumor y el pronóstico del paciente.

Principales métodos:

• Análisis de datos multi-ómicos espaciales de 31 muestras colorrectales humanas.
• El mapeo filogeográfico para ordenar eventos genéticos y definir trayectorias evolutivas.
• Integración de la transcriptómica unicelular y espacial para analizar los estados de las células epiteliales e inmunes.
• Identificación y validación de una firma de exclusión inmune (IEX).

Principales resultados:

• Los mapas filogeográficos individualizados revelaron trayectorias distintas de progresión tumoral (inestabilidad cromosómica [CIN+] y vías hipermutadas [HM]).
• Se identificaron programas epiteliales recurrentes y estados inmunes a lo largo de la progresión pseudotemporal.
• Se descubrió una firma de exclusión inmune (IEX) compuesta por DDR1, TGFBI, PAK4 y DPEP1, asociada con la progresión de CIN+ y la reducción de la infiltración celular citotóxica.
• El IEX demostró un valor pronóstico en cohortes independientes de cáncer colorrectal.

Conclusiones:

• La multiomía espacial proporciona una visión crítica de la coevolución entre el tumor colorrectal y el microambiente.
• El IEX identificado sirve como un biomarcador potencial para la estratificación del paciente y la terapia dirigida.
• Este atlas ofrece un valioso recurso para avanzar en la investigación y el tratamiento del cáncer colorrectal.