Ampliando el paisaje de los aminoácidos no canónicos en la biosíntesis de RiPP

Área de la Ciencia:

• Microbiología
• La bioquímica
• Química de los productos naturales

Sus antecedentes:

• Los avances en la secuenciación del ADN y la bioinformática revelan nuevas vías metabólicas en los microbios.
• Trabajos anteriores identificaron una red de grupos de genes regulados por la detección de quórum para RiPP en estreptococos, incluida la subfamilia GRC única para Streptococcus pneumoniae.

Objetivo del estudio:

• Para aclarar la vía de biosíntesis y las modificaciones enzimáticas de la subfamilia GRC de RiPPs.
• Caracterizar los nuevos aminoácidos no canónicos generados por las enzimas del grupo GRC.

Principales métodos:

• Ensayos bioquímicos in vivo y in vitro.
• Estrategia de co-ocurrencia bioinformática para la identificación de grupos de genes.

Principales resultados:

• Elucidación de una enzima tipo ThiF que instala un macrociclo de tiolactona en el extremo C.
• Caracterización de dos enzimas radicales S-adenosilmetionina (RaS) responsables de la formación de l-alo-Thr y didehidrohistidina.
• El producto GRC genera dos aminoácidos no canónicos, que difieren de otros RaS-RiPP que cuentan con macrociclos exóticos.

Conclusiones:

• El grupo GRC amplía el repertorio conocido de aminoácidos no proteinogénicos en la biosíntesis de RiPP.
• Las enzimas identificadas ofrecen potencial para aplicaciones biocatalíticas en la síntesis de productos naturales.