Un plásmido críptico es uno de los elementos genéticos más numerosos en el intestino humano

Área de la Ciencia:

• Microbiología
• La genética
• La bioinformática

Sus antecedentes:

• Los plásmidos son elementos de ADN extracromosómico en las bacterias, que a menudo proporcionan ventajas adaptativas.
• Los plásmidos crípticos carecen de funciones obvias, pero son frecuentes en las comunidades microbianas.
• La comprensión de los plásmidos crípticos es crucial para la investigación del microbioma.

Objetivo del estudio:

• Para caracterizar el plásmido críptico pBI143, prevalente en los microbiomas intestinales industrializados.
• Para investigar la dinámica evolutiva y la abundancia de pBI143.
• Para explorar las aplicaciones potenciales de pBI143.

Principales métodos:

• Análisis metagenómico de miles de muestras de microbioma intestinal.
• Análisis genéticos de poblaciones para inferir presiones de selección.
• Experimentos de transferencia de plásmidos in vitro.
• Identificación bioinformática de pBI143 y sus características.

Principales resultados:

• pBI143 es 14 veces más abundante que el crAsphage en los microbiomas intestinales humanos.
• La fuerte selección purificadora actúa sobre pBI143, indicada por los patrones de mutación.
• pBI143 es típicamente monoclonal dentro de los individuos, lo que sugiere un efecto prioritario.
• La transferencia de plásmidos ocurre entre las especies de Bacteroidales.
• pBI143 tiene aplicaciones potenciales en la identificación de la contaminación fecal y el control de la inflamación intestinal.

Conclusiones:

• pBI143 es un plásmido críptico dominante y altamente seleccionado en los microbiomas intestinales humanos.
• Su prevalencia y transferibilidad resaltan su importancia ecológica.
• pBI143 ofrece nuevas herramientas para el diagnóstico del microbioma y el monitoreo de la salud.