Un amplio espectro de expansiones de repetición en tándem en 338.963 humanos

Área de la Ciencia:

• La genómica
• La variación genética humana
• La bioinformática

Sus antecedentes:

• Las repeticiones en tándem (TR) comprenden ~ 6% del genoma humano.
• Las expansiones de TR están asociadas con más de 50 enfermedades humanas.
• Las bases de datos de variación genética existentes como gnomAD han pasado por alto en gran medida las TR.

Objetivo del estudio:

• Introducir TR-gnomAD, una base de datos de referencia completa para la variación de repetición en tándem.
• Proporcionar información sobre la prevalencia de la expansión de TR específica de la ascendencia y la asociación de enfermedades.
• Para ayudar a diferenciar las expansiones TR benignas de las patógenas.

Principales métodos:

• Desarrollo de TR-gnomAD utilizando datos de secuenciación de todo el genoma (WGS) de 338,963 individuos diversos.
• Análisis de 0,86 millones de repeticiones en tándem dentro del conjunto de datos TR-gnomAD.
• Comparación de las frecuencias del número de unidades TR entre diferentes ascendencias y cohortes de enfermedades.

Principales resultados:

• TR-gnomAD incluye una colección a gran escala de repeticiones en tándem de diversas poblaciones.
• La base de datos revela diferencias significativas en las frecuencias de número de unidad TR entre las ascendencias.
• TR-gnomAD distingue efectivamente las expansiones TR comunes, probablemente benignas, de las potencialmente patógenas encontradas en los grupos de enfermedades.

Conclusiones:

• TR-gnomAD es un recurso valioso para comprender la variación de repetición en tándem.
• Facilita la interpretación de las expansiones de TR en el contexto de las enfermedades genéticas.
• La base de datos apoya la investigación sobre la prevalencia de enfermedades específicas de la ascendencia relacionadas con los TR.