El desafío humano del SARS-CoV-2 revela la dinámica de respuesta local y sistémica

Área de la Ciencia:

• Inmunología
• Virología
• La genómica

Sus antecedentes:

• La pandemia de COVID-19 pone de relieve las lagunas en la comprensión de la inmunidad celular temprana al SARS-CoV-2.
• Existe un conocimiento limitado sobre la dinámica temporal de las respuestas del huésped durante las etapas iniciales de la infección.

Objetivo del estudio:

• Para resolver temporalmente las infecciones por SARS-CoV-2 abortadas, transitorias y sostenidas utilizando multiómicos de una sola célula.
• Identificar las respuestas celulares dinámicas en las células epiteliales e inmunes durante la infección temprana.
• Investigar las respuestas inmunológicas tempranas asociadas con la protección contra una infección prolongada.

Principales métodos:

• Perfiles multiómicos de una sola célula de hisopos nasofaríngeos y sangre de individuos seronegativos con SARS-CoV-2.
• Análisis temporal de las proporciones de tipo celular y de los estados de respuesta celular.
• Desarrollo y aplicación de la tubería computacional Cell2TCR para identificar las células T que responden al antígeno.

Principales resultados:

• Se observaron cambios rápidos en las proporciones de tipo celular y respuestas celulares dinámicas.
• La respuesta al interferón en sangre precedió a la respuesta nasofaríngea.
• La infiltración inmune nasofaríngea temprana se correlacionó con una infección transitoria; la infiltración posterior con una infección sostenida.
• La alta expresión de HLA-DQA2 antes de la inoculación se relacionó con la protección contra la infección prolongada.
• Las células ciliadas mostraron una alta tolerancia a la replicación viral, mientras que las células T y los macrófagos mostraron una infección no productiva.
• Se identificaron 54 estados de células T, incluidas las células T clonalmente expandidas con motivos convergentes de SARS-CoV-2.

Conclusiones:

• Los datos detallados de las series temporales proporcionan una visión completa de las respuestas epiteliales y inmunológicas de las células al SARS-CoV-2.
• Las respuestas inmunes dinámicas tempranas se asocian con la protección contra la infección sostenida.
• La tubería Cell2TCR ayuda a identificar y agrupar las células T que responden al antígeno.