El escaneo mutativo profundo de Spike ayuda a predecir el éxito de los clados de SARS-CoV-2

Área de la Ciencia:

• Virología
• Biología molecular
• Inmunología

Sus antecedentes:

• Las variantes del SARS-CoV-2 acumulan mutaciones de la proteína del pico.
• Estas mutaciones influyen en la evasión inmune, la unión ACE2 y la entrada celular.
• Comprender los efectos de la mutación es clave para predecir la evolución viral.

Objetivo del estudio:

• Trazar un mapa exhaustivo de los efectos funcionales de más de 9,000 mutaciones en las proteínas del pico XBB.1.5 y BA.2 del SARS-CoV-2.
• Para evaluar cómo estas mutaciones afectan la unión ACE2, la entrada celular y el escape del suero humano.
• Para correlacionar los efectos de la mutación de la proteína del pico con las tasas de crecimiento del clado SARS-CoV-2.

Principales métodos:

• Utilizó el escaneo mutativo profundo del pseudovirus.
• Efectos medidos de más de 9.000 mutaciones de la proteína del pico en la unión ACE2 y la entrada celular.
• Se evaluó el escape de neutralización del suero humano después de la infección por SARS-CoV-2.

Principales resultados:

• Las mutaciones fuera del dominio de unión al receptor (RBD) afectan significativamente la unión al ACE2.
• Las mutaciones de escape séricas más fuertes identificadas dentro de la RBD (sitios 357, 420, 440, 456, 473), con respuestas individuales variables.
• Se encontraron mutaciones de escape fuera del RBD, a menudo disminuyendo la unión al ACE2 mediante la modulación de la conformación del RBD.
• Los fenotipos de las proteínas de picos se correlacionan con las tasas de crecimiento del clado SARS-CoV-2.

Conclusiones:

• Las mutaciones de la proteína del pico fuera de la RBD juegan un papel significativo en la evolución viral.
• Los efectos de la mutación en la unión ACE2 y el escape inmune varían, lo que afecta la aptitud viral.
• El estudio proporciona datos para mejorar las predicciones de la evolución futura del SARS-CoV-2 y la aparición de variantes.