La arquitectura tridimensional del genoma persiste en una muestra de piel de mamut lanudo de hace 52.000 años

Área de la Ciencia:

• La paleogenómica
• Biología molecular
• Biología evolutiva

Sus antecedentes:

• El análisis del ADN antiguo (ADN) generalmente se basa en ADN fragmentado y comparaciones con parientes modernos.
• La preservación de la arquitectura del genoma antiguo, incluidas las estructuras de orden superior, es un desafío para estudiar.

Objetivo del estudio:

• Para investigar el estado de conservación de la antigua arquitectura del genoma del mamut lanudo.
• Utilizar técnicas avanzadas para ensamblar y analizar el genoma del mamut y su organización estructural.

Principales métodos:

• PaleoHi-C fue empleado para mapear los contactos de cromatina en la piel de mamuts antiguos.
• Se realizó el ensamblaje del genoma, produciendo andamios de longitud cromosómica.
• Se realizaron análisis comparativos con tejidos de elefantes modernos.

Principales resultados:

• La piel de mamut lanudo de 52.000 años de antigüedad conservó su antigua arquitectura genómica.
• Se identificaron territorios cromosómicos, compartimentos, bucles, cuerpos de Barr y superdominios inactivos del cromosoma X (Xi).
• Los compartimentos del genoma del mamut se parecían más a la piel del elefante asiático que a los tejidos de otros elefantes.
• El mamut Xi exhibió una arquitectura tetrádica única, diferente de las estructuras bipartitas de humanos y ratones.

Conclusiones:

• El ADN del mamut antiguo puede preservar la compleja arquitectura del genoma, ofreciendo una ventana única a las especies extintas.
• Los análisis comparativos revelan posibles diferencias regulatorias entre mamuts y elefantes a nivel de transcripción génica.
• El mecanismo de conservación puede incluir el liofilización espontánea y la transición al vidrio de la muestra.