La pesca del proteoma para la detección de aptamer ortogonal basado en CRISPR/Cas12a

Área de la Ciencia:

• Biotecnología
• Diagnóstico molecular
• Investigación del cáncer

Sus antecedentes:

• La detección de biomarcadores de proteínas séricas es compleja debido a la naturaleza intrincada del suero.
• Los métodos existentes se enfrentan a desafíos en la amplificación de proteínas multiplexadas y la estabilidad del aptamer en suero.

Objetivo del estudio:

• Desarrollar una nueva plataforma para la detección eficiente y precisa de biomarcadores de cáncer de pulmón de células no pequeñas (CPNPC) en suero.
• Establecer un método de diagnóstico rentable y de alto rendimiento para la detección temprana del cáncer.

Principales métodos:

• Utilizó una corona de proteínas de nanopartículas magnéticas para la pesca de proteomas a partir de suero.
• Desarrolló una plataforma de detección de aptamer múltiple ortogonal (COMPASS) basada en CRISPR / Cas12a.
• Se identificó un panel de cuatro de los nueve (FOON) (HE4, NSE, AFP, VEGF165) para el diagnóstico de CPNM.

Principales resultados:

• El panel FOON logró una alta precisión diagnóstica para el NSCLC: 95.56% (ROC-AUC = 99.40%) en cohortes internas y 89.58% (ROC-AUC = 95.41%) en cohortes externas.
• La tecnología COMPASS abordó con éxito los desafíos en la amplificación de proteínas séricas multiplexadas y la degradación del aptamer.
• Demostró la viabilidad de COMPASS para la detección de biomarcadores sensibles y específicos.

Conclusiones:

• La plataforma COMPASS proporciona una solución de diagnóstico fácil, rentable e inteligente para el NSCLC.
• Esta tecnología tiene el potencial para la detección de cáncer en grandes cohortes y el diagnóstico precoz.
• El método desarrollado supera las limitaciones de las técnicas tradicionales de detección de biomarcadores séricos.