El etiquetado de proximidad fotocatalítico a múltiples escalas revela vecinos de la superficie celular en y entre las...

Área de la Ciencia:

• La bioquímica
• Proteomía
• Biología celular

Sus antecedentes:

• La proteómica de etiquetado de proximidad (PLP) ofrece información sobre las interacciones de las proteínas dentro de las células.
• Los métodos PLP existentes tienen limitaciones en cuanto a resolución y alcance.

Objetivo del estudio:

• Desarrollar un método PLP multiscala con resolución ajustable para el mapeo de vecindarios de proteínas.
• Para perfilar las interacciones proteicas del receptor del factor de crecimiento epidérmico oncogénico (EGFR) y las sinapsis célula-célula.

Principales métodos:

• Utilizó un fotocatalizador comercialmente disponible, Eosina Y, activado por la luz visible.
• Se emplean foto sondas con diferentes radios de etiquetado para el análisis a múltiples escalas.
• Vecinos de proteínas validados mediante análisis inmunológicos y predicción AlphaFold-Multimer.

Principales resultados:

• Se han perfilado con éxito los vecindarios de proteínas del EGFR, identificando más de 20 vecinos validados.
• Redes de proteínas mapeadas en las sinapsis célula-célula inducidas por células T y células CAR T.
• Demostró la capacidad de la plataforma para mapear redes de proteínas locales y distales en y entre las superficies celulares.

Conclusiones:

• La plataforma PLP multiscala integrada proporciona una herramienta poderosa para el mapeo de interactomas de la superficie celular.
• Este enfoque ayuda a identificar socios horizontales de señalización y objetivos inmunoterapéuticos potenciales.
• El método ofrece una resolución ajustable para diversas investigaciones biológicas.