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Updated: Jun 14, 2025

11:22
Microbiota Analysis Using Two-step PCR and Next-generation 16S rRNA Gene Sequencing
Published on: October 15, 2019
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Diversidad microbiana inexplorada de 2.500 metagenomas de alimentos y vínculos con el microbioma humano
Niccolò Carlino1, Aitor Blanco-Míguez1, Michal Punčochář1
1Department of Cellular, Computational and Integrative Biology, University of Trento, Trento, Italy.
Cell
|August 30, 2024
Resumen
El recurso curatedFoodMetagenomicData (cFMD) revela una amplia diversidad microbiana en los alimentos. Estos microbios alimentarios contribuyen al microbioma intestinal humano, y algunos pueden transferirse de los alimentos al intestino.
Área de la Ciencia:
- Microbiología
- La metagenómica
- Ciencias de la alimentación
Sus antecedentes:
- Los alimentos albergan microbiomas complejos que influyen en el microbioma intestinal humano.
- La diversidad y el impacto de estos microbiomas alimentarios no se comprenden completamente.
Objetivo del estudio:
- Crear un recurso completo de datos metagenómicos de alimentos.
- Para explorar la diversidad de especies microbianas dentro de los alimentos.
- Investigar la contribución de los microbios alimenticios al microbioma intestinal humano.
Principales métodos:
- Integrado 1.950 recién secuenciados y 583 metagenomas de alimentos públicos.
- Se generaron 10.899 genomas ensamblados por metagenoma (MAG) a partir de muestras de alimentos.
- Los MAG analizados se compararon con más de 20 000 metagenomas humanos.
Principales resultados:
- El recurso curatedFoodMetagenomicData (cFMD) contiene 10.899 MAG, incluidos 320 taxones nuevos.
- Se observó una importante diversidad microbiana dentro y entre las categorías de alimentos.
- Los microbios alimenticios constituyen aproximadamente el 3% del microbioma intestinal humano adulto.
- Se ha identificado la transmisión potencial de los alimentos al intestino y la colonización de especies microbianas específicas.
Conclusiones:
- El recurso cFMD amplía significativamente el conocimiento de los microbiomas alimentarios.
- Los microbiomas alimentarios juegan un papel en la formación del microbioma intestinal humano.
- La metagenómica se puede aplicar a la calidad, seguridad y autenticación de los alimentos.
Palabras clave:
el alimentomicrobioma de los alimentosEl microbioma humanoanálisis del microbioma a gran escalaConjunto metagenómicoMetagenomíaGenómica a nivel de cepaDiversidad microbiana no explorada
