Las inversiones de ADN intragénico amplían la capacidad de codificación bacteriana

Área de la Ciencia:

• Microbiología
• La genómica
• La bioinformática

Sus antecedentes:

• Las poblaciones bacterianas exhiben heterogeneidad, no clonalidad estricta, debido a mecanismos como la variación de fase.
• La variación de fase, a menudo mediada por inversiones de ADN, altera la expresión génica e impacta la aptitud y supervivencia bacteriana.
• Las inversiones de ADN pueden invertir las orientaciones de los promotores, controlando la transcripción génica.

Objetivo del estudio:

• Desarrollar una herramienta computacional (PhaVa) para identificar inversiones de ADN en datos de secuenciación de larga lectura.
• Descubrir y caracterizar una nueva clase de inversiones de ADN, denominadas "invertones intragénicos", ubicadas dentro de los genes.

Principales métodos:

• Desarrollo de la herramienta computacional PhaVa para la detección de la inversión del ADN.
• Análisis de conjuntos de datos de secuenciación de larga lectura de aislamientos bacterianos y arqueológicos.
• Validación experimental de los invertones intragénicos identificados en *Bacteroides thetaiotaomicron*.

Principales resultados:

• Identificación de 372 nuevos inversionistas intragénicos en diversos genomas bacterianos y arqueos.
• Demostración de que los invertones intragénicos permiten a los genes codificar múltiples variantes de proteínas al invertir las secuencias internas de ADN.
• Validación experimental de diez invertones intragénicos y caracterización de uno en el gen *thiC*.

Conclusiones:

• Los invertones intragénicos representan un descubrimiento significativo, expandiendo la capacidad de codificación de los genomas bacterianos.
• PhaVa es una herramienta valiosa para identificar las inversiones de ADN, lo que facilita la investigación adicional sobre la dinámica del genoma bacteriano.
• Este mecanismo proporciona a las bacterias una nueva estrategia para generar diversidad de proteínas y adaptarse a los cambios ambientales.