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Updated: Jun 11, 2025

Quantification of Site-specific Protein Lysine Acetylation and Succinylation Stoichiometry Using Data-independent Acquisition Mass Spectrometry
Published on: April 4, 2018
Perfilamiento del aciloma basado en la actividad con N-N-fenilsulfonil) amidas para la acilación selectiva de lisina
Elizabeth M Ryan1, Michael A Norinskiy1, Amy K Bracken1
1Department of Chemistry and Chemical Biology, Cornell University, Ithaca, New York 14853, United States.
Los investigadores desarrollaron un perfil de aciloma basado en la actividad (ABAP) para mapear las acilaciones de lisina en las células. Este método permite un control preciso y la cuantificación global de las modificaciones de proteínas, avanzando las estrategias terapéuticas.
Área de la Ciencia:
- Biología Química
- Proteomía
- Modificaciones posteriores a la traducción
Sus antecedentes:
- Las acilaciones de lisina son modificaciones traslacionales cruciales que expanden la diversidad de los proteomas.
- Los métodos actuales para la acilación de lisina dirigida carecen de cuantificación global y se basan en enfoques genéticos o no específicos.
Objetivo del estudio:
- Desarrollar una estrategia quimioproteómica para la introducción específica del sitio y el mapeo global de las acilaciones de lisina.
- Permitir el análisis cuantitativo de las acilaciones de lisina tanto artificiales como endógenas en células humanas.
Principales métodos:
- Perfilamiento del aciloma basado en la actividad (ABAP) utilizando nuevas N- ((cianometil) -N- ((fenilsulfonil) amidas y sondas centradas en la lisina.
- Mapeo y cuantificación de las acilaciones de lisina introducidas y endógenas en todo el proteoma.
Principales resultados:
- Cuantificación exitosa de las acilaciones artificiales y redescubrimiento de las acilaciones endógenas de lisina.
- Identificación de sondas paralog-selectivas dirigidas a las lisinas conservadas en las proteínas antivirales, alterando las interacciones del ARN.
- Demostración de la acetilación dirigida que induce cambios conformacionales en las proteínas y alteraciones funcionales en las enzimas metabólicas.
Conclusiones:
- ABAP proporciona una plataforma versátil para el control biomimético de la función de las proteínas a través de la acilación de lisina dirigida.
- La estrategia permite la elaboración de perfiles globales de las acilaciones de lisina, con aplicaciones potenciales en el desarrollo terapéutico y la comprensión biológica.
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