Colonistas parecidos a los virus de los microbiomas humanos

Área de la Ciencia:

• Biología molecular
• Microbiología
• La genómica

Sus antecedentes:

• Los elementos de ARN hereditarios representan un aspecto poco comprendido de la biología molecular.
• La diversidad y la prevalencia de ARN no codificantes y reguladores son cada vez más reconocidas.

Objetivo del estudio:

• Para describir una clase recientemente identificada de elementos de ARN hereditarios, llamados "obeliscos".
• Para caracterizar sus propiedades genómicas, estructurales y filogenéticas.
• Investigar su prevalencia en los microbiomas globales y humanos.

Principales métodos:

• Análisis bioinformático de las secuencias y estructuras de ARN.
• Análisis filogenético para determinar las relaciones evolutivas.
• Análisis de datos metatranscriptómicos para evaluar la prevalencia en varios entornos.
• Identificación de un huésped bacteriano para un obelisco específico.

Principales resultados:

• Descubrimiento de "obeliscos": moléculas circulares de ARN (~ 1 kb) con estructuras similares a varillas y marcos de lectura abiertos que codifican proteínas Oblin.
• Identificación de un subconjunto que contiene ribozimas cabeza de martillo.
• Los obeliscos forman un grupo filogenético distinto.
• Se han identificado más de 29.000 obeliscos distintos en todo el mundo.
• Prevalencia alta en microbiomas humanos (en heces y por vía oral).
• Establecido Streptococcus sanguinis como huésped para un obelisco, con mantenimiento no esencial para el crecimiento bacteriano.

Conclusiones:

• Los obeliscos representan una clase novedosa y diversa de elementos de ARN hereditarios.
• Han colonizado varios nichos ecológicos, incluido el microbioma humano, en gran parte sin ser notados.
• Se necesita más investigación para determinar el impacto funcional y la importancia biológica de los obeliscos.