Secuenciación de glicanos basada en la detección de nanoporos asistida por glucosidasa

Área de la Ciencia:

• Biotecnología
• Química analítica
• Biología molecular

Sus antecedentes:

• Los sensores de nanoporo son prometedores para el análisis de glicanos, pero la secuenciación continua sigue sin probarse.
• La identificación precisa de los glicanos complejos es crucial para el avance de las tecnologías de secuenciación basadas en nanoporos.

Objetivo del estudio:

• Demostrar la viabilidad de la secuenciación continua de glicanos utilizando tecnología de nanoporos combinada con la hidrólisis de la glucosidasa.
• Establecer una tecnología de secuenciación de glicano a nivel de una sola molécula superando las limitaciones actuales.

Principales métodos:

• Utilizó la tecnología de nanoporos con reacciones de hidrolización de glucosidasa para la secuenciación de glicano.
• Cambios controlados en la corriente eléctrica durante la translocación del producto de la hidrólisis del glicano a través de un nanoporo.
• Empleó el aprendizaje automático para mejorar la precisión de la secuenciación e introdujo la estrategia de "secuenciación inversa".

Principales resultados:

• Se logró una precisión de secuenciación de más del 98% para los glicanos utilizando el aprendizaje automático.
• Secuenciado con éxito hasta diez unidades consecutivas en cadenas de glicano naturales.
• Demostró un aumento de 5 veces en la eficiencia de secuenciación en comparación con los métodos tradicionales.

Conclusiones:

• El sistema de nanoporo-glucosidasa desarrollado es factible para la secuenciación continua de glicano.
• El enfoque de "secuenciación inversa" elimina la necesidad de bibliotecas de huellas dactilares de glicano.
• Esta estrategia ofrece un camino prometedor hacia la tecnología de secuenciación de glicano a nivel de una sola molécula.