Ampliando el atlas del microbioma intestinal humano de África

Área de la Ciencia:

• Investigación del microbioma
• Genética de las poblaciones
• Epidemiología de enfermedades infecciosas

Sus antecedentes:

• La investigación sobre el microbioma intestinal es vital para comprender la salud, pero carece de representación de los países de ingresos bajos y medios.
• El proyecto AWI-Gen 2 Microbiome aborda esta brecha mediante el estudio de diversas poblaciones africanas.

Objetivo del estudio:

• Investigar la composición del microbioma intestinal y su asociación con factores geográficos, de estilo de vida y clínicos en mujeres africanas.
• Identificar nuevas firmas microbianas relacionadas con los cambios en el estilo de vida y la infección por VIH.

Principales métodos:

• Estudio transversal de 1.801 mujeres de Burkina Faso, Ghana, Kenia y Sudáfrica.
• Secuenciación metagenómica para analizar los metagenomas intestinales.
• Integración de los biomarcadores clínicos y los datos demográficos.

Principales resultados:

• Se identificaron taxones geográficos y asociados al estilo de vida, con poblaciones urbanas que muestran una reducción de Treponema y Cryptobacteroides y un aumento de Bifidobacterium.
• Descubrió 1.005 genomas bacterianos ensamblados por metagenoma.
• Se encontró una susceptibilidad potencial a los antibióticos que impulsa la ausencia de Treponema succinifaciens en entornos urbanos.
• Se identificó una nueva firma de infección por VIH que incluye Dysosmobacter welbionis y Enterocloster sp.

Conclusiones:

• Esta es la mayor encuesta representativa de la población de metagenomas intestinales en individuos africanos hasta la fecha.
• Los hallazgos destacan las variaciones significativas del microbioma vinculadas a diversos entornos y estilos de vida en toda África.
• El estudio proporciona un rico conjunto de datos para futuros descubrimientos relacionados con el microbioma, incluidas las asociaciones con la infección por VIH.