Daño endógeno del ADN en los sitios de transcripción terminada

Área de la Ciencia:

• Biología molecular
• La genética
• La bioquímica

Sus antecedentes:

• El daño al ADN es un factor conocido de cáncer, envejecimiento y enfermedades neurodegenerativas.
• El conocimiento existente identifica tres mecanismos relacionados con la transcripción que causan daño al ADN.
• Las causas precisas y los tipos de daño en el ADN siguen siendo en gran medida desconocidos.

Objetivo del estudio:

• Identificar nuevos agentes intermedios y fuentes de daño en el ADN.
• Para descubrir un cuarto mecanismo de daño relacionado con la transcripción del ADN.
• Para investigar el papel de la terminación de la transcripción en el daño del ADN.

Principales métodos:

• Las proteínas diseñadas para capturar ADN de cadena única (ssDNA) terminan con polaridad 3 'en células bacterianas y humanas.
• Se utilizó la secuenciación de ARN directo y la secuenciación simultánea de ARN de extremo 5' y 3' (SEnd-seq).
• Empleó la ARN polimerasa mutante (RNAP) que lee a través de los terminadores.

Principales resultados:

• Identificó daños endógenos en el ADN en sitios de transcripciones terminadas como una nueva fuente.
• Se han observado frecuentes focos espontáneos de 3'-ssDNA en Escherichia coli, relacionados con la replicación del ADN.
• Descubrieron puntos calientes distintos del extremo 3'-ssDNA cerca de secuencias similares al terminador de transcripción, que coinciden con los 3'-terminos del ARN.

Conclusiones:

• La terminación o pausa de la transcripción puede promover directamente el daño del ADN.
• Este mecanismo recién identificado contribuye a la inestabilidad genómica.
• Los hallazgos ofrecen nuevos conocimientos sobre las vías de daño del ADN relevantes para la enfermedad y el envejecimiento.