Bases estructurales para el reconocimiento de la nucleolina del promotor G-cuadruplex de MYC

Área de la Ciencia:

• Biología molecular
• Biología estructural
• La epigenética

Sus antecedentes:

• El promotor del oncogén MYC G-quadruplex (MycG4) es un regulador clave de la transcripción en las células inmortales.
• La nucleolina es una proteína que se une a MycG4 con alta afinidad, mostrando preferencia sobre el ARN.

Objetivo del estudio:

• Para aclarar la base estructural de la interacción de la nucleolina con MycG4.
• Para confirmar la unión de la nucleolina con el MycG4 en un contexto celular.
• Comprender el papel de esta interacción en la regulación transcripcional epigenética.

Principales métodos:

• Cristalografía de rayos X para determinar la estructura del complejo nucleolina-MycG4.
• Espectroscopia de resonancia magnética nuclear (RMN) para estudiar las interacciones con bucles específicos.
• El clivado bajo objetivos y la secuenciación por tagmentación (CUT&Tag) para validar la unión en células.

Principales resultados:

• La estructura cristalina revela un G-cuadruplex paralelo de tres tetras unido por los dominios de unión al ARN (RBD) 1 y 2 de la nucleolina, y Linker12.
• Se demostró por RMN que las RBD3 y RBD4 de Nucleolin se unen a los bucles 1-nt de MycG4.
• CUT&Tag confirmó que la nucleolina se une a MycG4 dentro de las células.

Conclusiones:

• La nucleolina reconoce los cuádruplexos G a través de interacciones multivalentes basadas en la conformación G4.
• Los cuádruplexos G son probablemente sustratos celulares primarios para la nucleolina.
• Este estudio proporciona información sobre la regulación epigenética de la transcripción mediada por G-cuadruplex y ayuda en el descubrimiento de fármacos dirigidos a G4.