La arquitectura genética de la regulación cis específica del tipo de célula en el maíz

Área de la Ciencia:

• La genómica
• Biología vegetal
• La genética evolutiva

Sus antecedentes:

• La expresión génica y los fenotipos complejos están regulados por elementos cis-reguladores.
• Comprender los efectos de las variantes genéticas en la regulación cis es crucial pero limitado.

Objetivo del estudio:

• Investigar la diversidad cis-reguladora en el maíz utilizando genómica de una sola célula.
• Identificar los elementos cis-reguladores exclusivos del maíz domesticado.
• Determinar cómo las variantes genéticas influyen en la accesibilidad de la cromatina y la variación de los rasgos.

Principales métodos:

• Genómica de una sola célula en más de 0,7 millones de núcleos de 172 variedades de maíz.
• Principios de la genética de poblaciones para el mapeo de variantes genéticas.
• Integración de datos de variantes con la variación de rasgos y la diferenciación de poblaciones.

Principales resultados:

• Descubrió elementos cis-reguladores específicos para el maíz domesticado y el papel de la actividad del transposón.
• Variantes asociadas a la accesibilidad de la cromatina con efectos específicos para el tipo de célula.
• Se han identificado variantes en los sitios de unión de TEOSINTE BRANCHED1/CYCLOIDEA/PROLIFERATING CELL FACTOR como determinantes clave de la accesibilidad a la cromatina.

Conclusiones:

• La adaptación local ha recableado las redes reguladoras en contextos celulares específicos.
• Las redes reguladoras alteradas afectan el tiempo de floración del maíz.
• Las variantes genéticas en los elementos cis-reguladores son factores clave de la diversidad fenotípica en el maíz.